RefSeq | NC_008818.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | aORI10010035 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 529 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.5312 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 5011..5539 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
TGCTCCCCCCAGACTAGGCTAGTTCTTAGCTAGCCCCTCCTTAAAACTGGCGGGAGACTACTAGCCCCACTCTGGGCCCACTCCACAGGAAAGCTAGGGGTCGTATGACGAACTGTTTCACAATAAGAACGAAATATTCAGCACTAGCATGCACCAATGGTTGACTCTGGCACCCCTCAACTTCTAGTGCAGACAATACAGCATACAAGGATGAACTGGTAACTGCATAGCAATTGCAACGCTACTCTAGTTTATACAAACAGGCAAGTTTAAATAAGGGCCTATAAAGGATATGCGATGTAAATCCATTGTCCAATAATCTGATTCACAACTTGAATGCAAACTGCAATATGTATGTGAGTTCACAATTGTAACTCAGAGCTTCTGTCTACAGGCAATTGGGGGGTGCCAGGGTGTTTCCATGTGCTACAGCTGGCAGTGATCTTAGAGTCATTGCTGCCGTGATGGGTTTCAGTGTCTTGTGGCCCTATGGTGGGCTGGAGTGGAAGCTGAGGGGTTGTTTACCCTA
TGCTCCCCCCAGACTAGGCTAGTTCTTAGCTAGCCCCTCCTTAAAACTGGCGGGAGACTACTAGCCCCACTCTGGGCCCACTCCACAGGAAAGCTAGGGGTCGTATGACGAACTGTTTCACAATAAGAACGAAATATTCAGCACTAGCATGCACCAATGGTTGACTCTGGCACCCCTCAACTTCTAGTGCAGACAATACAGCATACAAGGATGAACTGGTAACTGCATAGCAATTGCAACGCTACTCTAGTTTATACAAACAGGCAAGTTTAAATAAGGGCCTATAAAGGATATGCGATGTAAATCCATTGTCCAATAATCTGATTCACAACTTGAATGCAAACTGCAATATGTATGTGAGTTCACAATTGTAACTCAGAGCTTCTGTCTACAGGCAATTGGGGGGTGCCAGGGTGTTTCCATGTGCTACAGCTGGCAGTGATCTTAGAGTCATTGCTGCCGTGATGGGTTTCAGTGTCTTGTGGCCCTATGGTGGGCTGGAGTGGAAGCTGAGGGGTTGTTTACCCTA
TGCTCCCCCCAGACTAGGCTAGTTCTTAGCTAGCCCCTCCTTAAAACTGGCGGGAGACTACTAGCCCCACTCTGGGCCCACTCCACAGGAAAGCTAGGGGTCGTATGACGAACTGTTTCACAATAAGAACGAAATATTCAGCACTAGCATGCACCAATGGTTGACTCTGGCACCCCTCAACTTCTAGTGCAGACAATACAGCATACAAGGATGAACTGGTAACTGCATAGCAATTGCAACGCTACTCTAGTTTATACAAACAGGCAAGTTTAAATAAGGGCCTATAAAGGATATGCGATGTAAATCCATTGTCCAATAATCTGATTCACAACTTGAATGCAAACTGCAATATGTATGTGAGTTCACAATTGTAACTCAGAGCTTCTGTCTACAGGCAATTGGGGGGTGCCAGGGTGTTTCCATGTGCTACAGCTGGCAGTGATCTTAGAGTCATTGCTGCCGTGATGGGTTTCAGTGTCTTGTGGCCCTATGGTGGGCTGGAGTGGAAGCTGAGGGGTTGTTTACCCTA
ORB
AT-rich region
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The information of repeat sequences |
Motif CTVGCCCCAC
Motif TCACAAYTDGAAYGC
Motif TSBASWGGMARBYKRGGGGT
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The result of BLAST |
Download
|