RefSeq NC_013156.1
DoriC accession number aORI10010080
OriC length 653 nt
OriC AT content 0.8086
The location of oriC region 970069..970721 nt
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OriC map
OriC sequences
GTTTCCACCGATAATAATCATGAATAGGTAGTTTCGAATTTTTGTTTTAACTGTATTATATACATTTCGAAAAATCGAACAATAGATTCAATTAATTATTTATTAACTTAAATATTTGACCATATATTTTACAATCGAATTTTAAAAAATATTGTGAATAAAACAATAAAATTAAAAAATAACATGAATCAAATAATATTTTGTATATCATAGAGAATCACAATTCCTAGAAGAAAACTTGAATAAAAATAAAAATAATATATAAATTATTCTAATAAAATAAAGTTAATTTTAATTCTTCTCATGAGAATTGCTGAAATATATGAAAAATAAAATAACGTGAATCAAAAATTATATTACATAAAAAACTATGAATCAAAAATTATTAGTAAATTAACAATATATCAAAACTATTTAAGATCAACAATTAAAAACAAAAAAGAAATATAAAACAGAAATAAATAAATACATGCCATGCAAAAACATATACAAAGAGATAAATCTTCAAAATGTCAGCAATATTGCAATGAAACATTGGTGGTTAAATCCACCTCATGAATCAAAAGTTTTATAAACAATTTTAACGAATATAATTGAACATTGATAAAATAATAAAATAAAAACAACCCATATAAAAAAATAAGGTGTCATTT
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GTTTCCACCGATAATAATCATGAATAGGTAGTTTCGAATTTTTGTTTTAACTGTATTATATACATTTCGAAAAATCGAACAATAGATTCAATTAATTATTTATTAACTTAAATATTTGACCATATATTTTACAATCGAATTTTAAAAAATATTGTGAATAAAACAATAAAATTAAAAAATAACATGAATCAAATAATATTTTGTATATCATAGAGAATCACAATTCCTAGAAGAAAACTTGAATAAAAATAAAAATAATATATAAATTATTCTAATAAAATAAAGTTAATTTTAATTCTTCTCATGAGAATTGCTGAAATATATGAAAAATAAAATAACGTGAATCAAAAATTATATTACATAAAAAACTATGAATCAAAAATTATTAGTAAATTAACAATATATCAAAACTATTTAAGATCAACAATTAAAAACAAAAAAGAAATATAAAACAGAAATAAATAAATACATGCCATGCAAAAACATATACAAAGAGATAAATCTTCAAAATGTCAGCAATATTGCAATGAAACATTGGTGGTTAAATCCACCTCATGAATCAAAAGTTTTATAAACAATTTTAACGAATATAATTGAACATTGATAAAATAATAAAATAAAAACAACCCATATAAAAAAATAAGGTGTCATTT
ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif CATGAATCAAAARTTWT

StartP-valueSite
5541.67e-09AAATCCACCTCATGAATCAAAAGTTTTATAAACAATT
3391.23e-08AATAAAATAACGTGAATCAAAAATTATATTACATAAA
191.51e-07CGATAATAATCATGAATAGGTAGTTTCGAATTTTTGT
3702.09e-07CATAAAAAACTATGAATCAAAAATTATTAGTAAATTA
1832.77e-07TAAAAAATAACATGAATCAAATAATATTTTGTATATC

Motif GGTGKY

StartP-valueSite
5377.38e-06ATGAAACATTGGTGGTTAAATCCACC
6441.41e-05AAAAAAATAAGGTGTCATTT

Motif TCCACC

StartP-valueSite
5472.02e-05GGTGGTTAAATCCACCTCATGAATCA
42.02e-05GTTTCCACCGATAATAATC
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
aORI10010080 100.0 653 0 0 1 653 1 653 0.0 1206