RefSeq GCF_000192395.2
Accession number NZ_CP017125.1
DoriC accession number ORI97013019
OriC length 295 nt
OriC AT content 0.80678
The location of oriC region 1016413..1016707 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif GTWGATAA

StartP-valueSite
2864.52e-06TAATATTTTTGGAGATAAAT
1063.31e-05TCAATTAAATGTAGATAAAACTAACAAT
1565.79e-05TTGTTGATAAGTTGATAAATAATAAATT
1485.79e-05TTAGTTAATTGTTGATAAGTTGATAAAT

Motif CCACVT

StartP-valueSite
2405.48e-05TGGATTTTCTCCACGTTTTCCACATT
98.94e-05ATCACTTACCTCCTTTACAAAAAA
2492.21e-04TCCACGTTTTCCACATTTTTAACAAG
363.31e-04TAAATAATTCACACCTAATTATATAA

Motif CAAGKM

StartP-valueSite
1745.70e-05ATAATAAATTCAAGGAACTAATTAAG
2611.28e-04ACATTTTTAACAAGTCTTTACTTTAT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI10010178 99.661 295 1 0 1 295 1 295 0.0 540
ORI96040576 92.568 296 19 3 1 295 1 294 0.0 422
ORI94040271 92.568 296 19 3 1 295 1 294 0.0 422
ORI94010839 87.205 297 28 10 3 295 3 293 0.0 329
ORI10010103 85.328 259 34 4 38 295 1 256 0.0 265