RefSeq GCF_000210415.1
Accession number NC_017173.1
DoriC accession number ORI97031256
OriC length 658 nt
OriC AT content 0.799392
The location of oriC region 4158860..4159517 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif SGGASG

StartP-valueSite
6456.77e-06TTATTCTGTTCGGAGGTTTATATT
1196.77e-06ACGAGTTTTTGGGACGCTTATATCAC

Motif GTGGATAA

StartP-valueSite
2855.83e-06AGTTAATATTGTGGATAAATTAGTTACA
3987.76e-06TTCACAGCTTGTGGATACTTTTGTGTAT
6211.21e-05TAATAACTTTGTGGAAAATATTAATTAT
3562.10e-05TGTTGATAATGTGCATAAATGTTATCAA
3476.06e-05AAATATACTTGTTGATAATGTGCATAAA

Motif CAACRMS

StartP-valueSite
85.60e-07TATTTTGCACCGCCTTTCAGATTT
5492.07e-05ATTAATTTATCAACACCATTATCCATA
1072.65e-05CTACTGTTGTCAACGAGTTTTTGGGAC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI93010593 99.848 658 1 0 1 658 1 658 0.0 1210
ORI93010591 99.848 658 1 0 1 658 1 658 0.0 1210