DoriC

RefSeq

GCF_000227665.2

Accession number

NZ_CP007030.1

DoriC accession number

ORI97010955

OriC length

259 nt

OriC AT content

0.683398

The location of oriC region

2158193..92 nt

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OriC map

OriC sequences

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5'-DnaA box-3' 3'-DnaA box-5' Spacer DnaA-trio ATP-DnaA box
AT-rich region GATC CtrA binding motif Fis binding site IHF binding site

The information of repeat sequences

Motif TTATCCACWGR

Start	P-value		Site
151	1.40e-07	TGCACTAGAC	TTATCCACAGG	TTTAGGCTGT
127	3.99e-07	TTTAAAAAGC	TTATCCACAGA	GTTTGCACTA
181	2.14e-06	TTTTTTAAAG	TTATTCACAGG	TACAATTAAC
72	5.90e-06	TAAAAAATTT	TTATACACTGA	TATTTTTCAT
214	9.19e-06	CATAGCGCAA	TTATCCCCTAA	ATCGGTCAAT

Motif AGGCKG

Start	P-value		Site
44	4.36e-05	TTTAGGTGTT	AGGCGG	ATAAAAATTA
165	1.33e-04	CCACAGGTTT	AGGCTG	TTTTTTAAAG

Motif ATAGSTCA

Start	P-value		Site
225	1.26e-05	TATCCCCTAA	ATCGGTCA	ATGAACACAA
7	4.08e-05	GCTGGG	ATAGGTCA	ATTATTAAGG
205	7.44e-05	AATTAACCTC	ATAGCGCA	ATTATCCCCT

Distribution of genes on leading or lagging strand

Distribution of nucleotide on leading or lagging strand

The result of BLAST

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subject_id	identity	aln_length	mismatches	gaps	q_start	q_end	s_start	s_end	e_value	bit_score
ORI94010863	85.441	261	30	8	3	259	3	259	0.0	265