RefSeq GCF_000231405.2
Accession number NZ_CP007032.1
DoriC accession number ORI97010956
OriC length 360 nt
OriC AT content 0.705556
The location of oriC region 284..643 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
rpmHTGAAGCACCTCCTTTGAGCAAAAGGACATTAAATAAAATATCCTTACAACAGATATCTTAAAAGATTATACTCTAGTTAATTTTATCATGTCAAGGTGAATAAAAGGAAAGAATGTGGATAACTCGTGGAAATAAAAAGTTATCCACTGTGTATAAATATCATTTATTACTGAAGTTTCTGTTGATAACCCATTCAAAACTTGGTATGATGTTTTTGCAACTCCATATTTCGATAATTTTCCAGGGATTATTTTAGTCACAGCTTACTATGATGTTAAGTTATCCACAAATGTGTATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTTTGCCTAAAAAATTTATTCTATTCAACAAGGGAGGTCCATTCdnaA
rpmHTGAAGCACCTCCTTTGAGCAAAAGGACATTAAATAAAATATCCTTACAACAGATATCTTAAAAGATTATACTCTAGTTAATTTTATCATGTCAAGGTGAATAAAAGGAAAGAATGTGGATAACTCGTGGAAATAAAAAGTTATCCACTGTGTATAAATATCATTTATTACTGAAGTTTCTGTTGATAACCCATTCAAAACTTGGTATGATGTTTTTGCAACTCCATATTTCGATAATTTTCCAGGGATTATTTTAGTCACAGCTTACTATGATGTTAAGTTATCCACAAATGTGTATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTTTGCCTAAAAAATTTATTCTATTCAACAAGGGAGGTCCATTCdnaA
rpmHTGAAGCACCTCCTTTGAGCAAAAGGACATTAAATAAAATATCCTTACAACAGATATCTTAAAAGATTATACTCTAGTTAATTTTATCATGTCAAGGTGAATAAAAGGAAAGAATGTGGATAACTCGTGGAAATAAAAAGTTATCCACTGTGTATAAATATCATTTATTACTGAAGTTTCTGTTGATAACCCATTCAAAACTTGGTATGATGTTTTTGCAACTCCATATTTCGATAATTTTCCAGGGATTATTTTAGTCACAGCTTACTATGATGTTAAGTTATCCACAAATGTGTATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTTTGCCTAAAAAATTTATTCTATTCAACAAGGGAGGTCCATTCdnaA
rpmHTGAAGCACCTCCTTTGAGCAAAAGGACATTAAATAAAATATCCTTACAACAGATATCTTAAAAGATTATACTCTAGTTAATTTTATCATGTCAAGGTGAATAAAAGGAAAGAATGTGGATAACTCGTGGAAATAAAAAGTTATCCACTGTGTATAAATATCATTTATTACTGAAGTTTCTGTTGATAACCCATTCAAAACTTGGTATGATGTTTTTGCAACTCCATATTTCGATAATTTTCCAGGGATTATTTTAGTCACAGCTTACTATGATGTTAAGTTATCCACAAATGTGTATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTTTGCCTAAAAAATTTATTCTATTCAACAAGGGAGGTCCATTCdnaA
rpmHTGAAGCACCTCCTTTGAGCAAAAGGACATTAAATAAAATATCCTTACAACAGATATCTTAAAAGATTATACTCTAGTTAATTTTATCATGTCAAGGTGAATAAAAGGAAAGAATGTGGATAACTCGTGGAAATAAAAAGTTATCCACTGTGTATAAATATCATTTATTACTGAAGTTTCTGTTGATAACCCATTCAAAACTTGGTATGATGTTTTTGCAACTCCATATTTCGATAATTTTCCAGGGATTATTTTAGTCACAGCTTACTATGATGTTAAGTTATCCACAAATGTGTATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTTTGCCTAAAAAATTTATTCTATTCAACAAGGGAGGTCCATTCdnaA
rpmHTGAAGCACCTCCTTTGAGCAAAAGGACATTAAATAAAATATCCTTACAACAGATATCTTAAAAGATTATACTCTAGTTAATTTTATCATGTCAAGGTGAATAAAAGGAAAGAATGTGGATAACTCGTGGAAATAAAAAGTTATCCACTGTGTATAAATATCATTTATTACTGAAGTTTCTGTTGATAACCCATTCAAAACTTGGTATGATGTTTTTGCAACTCCATATTTCGATAATTTTCCAGGGATTATTTTAGTCACAGCTTACTATGATGTTAAGTTATCCACAAATGTGTATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTTTGCCTAAAAAATTTATTCTATTCAACAAGGGAGGTCCATTCdnaA
rpmHTGAAGCACCTCCTTTGAGCAAAAGGACATTAAATAAAATATCCTTACAACAGATATCTTAAAAGATTATACTCTAGTTAATTTTATCATGTCAAGGTGAATAAAAGGAAAGAATGTGGATAACTCGTGGAAATAAAAAGTTATCCACTGTGTATAAATATCATTTATTACTGAAGTTTCTGTTGATAACCCATTCAAAACTTGGTATGATGTTTTTGCAACTCCATATTTCGATAATTTTCCAGGGATTATTTTAGTCACAGCTTACTATGATGTTAAGTTATCCACAAATGTGTATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTTTGCCTAAAAAATTTATTCTATTCAACAAGGGAGGTCCATTCdnaA
rpmhTGAAGCACCTCCTTTGAGCAAAAGGACATTAAATAAAATATCCTTACAACAGATATCTTAAAAGATTATACTCTAGTTAATTTTATCATGTCAAGGTGAATAAAAGGAAAGAATGTGGATAACTCGTGGAAATAAAAAGTTATCCACTGTGTATAAATATCATTTATTACTGAAGTTTCTGTTGATAACCCATTCAAAACTTGGTATGATGTTTTTGCAACTCCATATTTCGATAATTTTCCAGGGATTATTTTAGTCACAGCTTACTATGATGTTAAGTTATCCACAAATGTGTATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTTTGCCTAAAAAATTTATTCTATTCAACAAGGGAGGTCCATTCdnaa
rpmHTGAAGCACCTCCTTTGAGCAAAAGGACATTAAATAAAATATCCTTACAACAGATATCTTAAAAGATTATACTCTAGTTAATTTTATCATGTCAAGGTGAATAAAAGGAAAGAATGTGGATAACTCGTGGAAATAAAAAGTTATCCACTGTGTATAAATATCATTTATTACTGAAGTTTCTGTTGATAACCCATTCAAAACTTGGTATGATGTTTTTGCAACTCCATATTTCGATAATTTTCCAGGGATTATTTTAGTCACAGCTTACTATGATGTTAAGTTATCCACAAATGTGTATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTTTGCCTAAAAAATTTATTCTATTCAACAAGGGAGGTCCATTCdnaA
rpmHTGAAGCACCTCCTTTGAGCAAAAGGACATTAAATAAAATATCCTTACAACAGATATCTTAAAAGATTATACTCTAGTTAATTTTATCATGTCAAGGTGAATAAAAGGAAAGAATGTGGATAACTCGTGGAAATAAAAAGTTATCCACTGTGTATAAATATCATTTATTACTGAAGTTTCTGTTGATAACCCATTCAAAACTTGGTATGATGTTTTTGCAACTCCATATTTCGATAATTTTCCAGGGATTATTTTAGTCACAGCTTACTATGATGTTAAGTTATCCACAAATGTGTATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTTTGCCTAAAAAATTTATTCTATTCAACAAGGGAGGTCCATTCdnaA
rpmHTGAAGCACCTCCTTTGAGCAAAAGGACATTAAATAAAATATCCTTACAACAGATATCTTAAAAGATTATACTCTAGTTAATTTTATCATGTCAAGGTGAATAAAAGGAAAGAATGTGGATAACTCGTGGAAATAAAAAGTTATCCACTGTGTATAAATATCATTTATTACTGAAGTTTCTGTTGATAACCCATTCAAAACTTGGTATGATGTTTTTGCAACTCCATATTTCGATAATTTTCCAGGGATTATTTTAGTCACAGCTTACTATGATGTTAAGTTATCCACAAATGTGTATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTTTGCCTAAAAAATTTATTCTATTCAACAAGGGAGGTCCATTCdnaA
5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGKATAACT

StartP-valueSite
1143.38e-07AAGGAAAGAATGTGGATAACTCGTGGAAATA
3031.28e-06TGTATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTTTGCC
2912.92e-06TATCCACAAATGTGTATAAGTTTGTGTATAA
1487.09e-06AGTTATCCACTGTGTATAAATATCATTTATT
1809.30e-06CTGAAGTTTCTGTTGATAACCCATTCAAAAC

Motif GSAVSTCC

StartP-valueSite
51.24e-06TGAAGCACCTCCTTTGAGCAAA
2171.07e-05TGATGTTTTTGCAACTCCATATTTCGAT
3491.33e-05ATTCAACAAGGGAGGTCCATTC

Motif AAGTTATCCAC

StartP-valueSite
2773.06e-07CTATGATGTTAAGTTATCCACAAATGTGTAT
1373.06e-07TGGAAATAAAAAGTTATCCACTGTGTATAAA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI92710474 76.289 194 33 13 135 321 128 315 1.19e-19 92
ORI10010187 76.289 194 33 13 135 321 128 315 1.19e-19 92
ORI96010268 85.882 85 8 4 275 356 273 356 1.54e-18 88
ORI95010942 85.882 85 6 6 275 356 274 355 5.54e-18 86
ORI96010239 72.81 331 59 27 47 360 51 367 1.99e-17 84