RefSeq GCF_000231405.2
Accession number NZ_CP007032.1
DoriC accession number ORI97010957
OriC length 236 nt
OriC AT content 0.728814
The location of oriC region 1994..2229 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGWGGA

StartP-valueSite
607.96e-05TTTGTGGACATGTGGATAATTCCTCA
527.96e-05AAACTTATTTTGTGGACATGTGGATA
2231.52e-04ATGTTAATCATGAGGAGGTTATTC

Motif SASAAG

StartP-valueSite
1492.46e-04TCCACAAAGAGACAAGCTATAGTACT
742.46e-04GATAATTCCTCAGAAGTTATTCACAT

Motif ACGMCTA

StartP-valueSite
1972.09e-05ATTATTATTCACGCCTACTTATTCCTA
1686.68e-05TAGTACTATAACGACTAAATTAATATC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score