RefSeq GCF_000233715.2
Accession number NC_021184.1
DoriC accession number ORI97010304
OriC length 373 nt
OriC AT content 0.680965
The location of oriC region 179..551 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
rpmHTTAAGACAGCATCCCCCTTACCACTTGTTAGATTACCAAAAATATGGAAAATTATAGGCGTATGTTCTCATTATATAGTATGCCCTTATTTTGAGTCAAGCAATGGTTTTGCAGTATTACTTATTATAGTATATACTGGAATTACACAGCATGTTAATAACTAGCTGTGGGAACTGTGGAAATTGTTTAAAAAATTACATATATTTCAATTTATTGGATACTTATCCAGGGTACAATTTTTATTGAATAGCTTATTAAGTTTTGGTATCATTTTTCTTAGCCCTAAGACACACAGACTTATCCACAGCATGTGCATAAGTCTGTGTGTAAATTGTTATTATAAAAATTTTATTATCCTGAGGGGGACCGGCCAdnaA
rpmHTTAAGACAGCATCCCCCTTACCACTTGTTAGATTACCAAAAATATGGAAAATTATAGGCGTATGTTCTCATTATATAGTATGCCCTTATTTTGAGTCAAGCAATGGTTTTGCAGTATTACTTATTATAGTATATACTGGAATTACACAGCATGTTAATAACTAGCTGTGGGAACTGTGGAAATTGTTTAAAAAATTACATATATTTCAATTTATTGGATACTTATCCAGGGTACAATTTTTATTGAATAGCTTATTAAGTTTTGGTATCATTTTTCTTAGCCCTAAGACACACAGACTTATCCACAGCATGTGCATAAGTCTGTGTGTAAATTGTTATTATAAAAATTTTATTATCCTGAGGGGGACCGGCCAdnaA
rpmHTTAAGACAGCATCCCCCTTACCACTTGTTAGATTACCAAAAATATGGAAAATTATAGGCGTATGTTCTCATTATATAGTATGCCCTTATTTTGAGTCAAGCAATGGTTTTGCAGTATTACTTATTATAGTATATACTGGAATTACACAGCATGTTAATAACTAGCTGTGGGAACTGTGGAAATTGTTTAAAAAATTACATATATTTCAATTTATTGGATACTTATCCAGGGTACAATTTTTATTGAATAGCTTATTAAGTTTTGGTATCATTTTTCTTAGCCCTAAGACACACAGACTTATCCACAGCATGTGCATAAGTCTGTGTGTAAATTGTTATTATAAAAATTTTATTATCCTGAGGGGGACCGGCCAdnaA
rpmHTTAAGACAGCATCCCCCTTACCACTTGTTAGATTACCAAAAATATGGAAAATTATAGGCGTATGTTCTCATTATATAGTATGCCCTTATTTTGAGTCAAGCAATGGTTTTGCAGTATTACTTATTATAGTATATACTGGAATTACACAGCATGTTAATAACTAGCTGTGGGAACTGTGGAAATTGTTTAAAAAATTACATATATTTCAATTTATTGGATACTTATCCAGGGTACAATTTTTATTGAATAGCTTATTAAGTTTTGGTATCATTTTTCTTAGCCCTAAGACACACAGACTTATCCACAGCATGTGCATAAGTCTGTGTGTAAATTGTTATTATAAAAATTTTATTATCCTGAGGGGGACCGGCCAdnaA
rpmHTTAAGACAGCATCCCCCTTACCACTTGTTAGATTACCAAAAATATGGAAAATTATAGGCGTATGTTCTCATTATATAGTATGCCCTTATTTTGAGTCAAGCAATGGTTTTGCAGTATTACTTATTATAGTATATACTGGAATTACACAGCATGTTAATAACTAGCTGTGGGAACTGTGGAAATTGTTTAAAAAATTACATATATTTCAATTTATTGGATACTTATCCAGGGTACAATTTTTATTGAATAGCTTATTAAGTTTTGGTATCATTTTTCTTAGCCCTAAGACACACAGACTTATCCACAGCATGTGCATAAGTCTGTGTGTAAATTGTTATTATAAAAATTTTATTATCCTGAGGGGGACCGGCCAdnaA
rpmHTTAAGACAGCATCCCCCTTACCACTTGTTAGATTACCAAAAATATGGAAAATTATAGGCGTATGTTCTCATTATATAGTATGCCCTTATTTTGAGTCAAGCAATGGTTTTGCAGTATTACTTATTATAGTATATACTGGAATTACACAGCATGTTAATAACTAGCTGTGGGAACTGTGGAAATTGTTTAAAAAATTACATATATTTCAATTTATTGGATACTTATCCAGGGTACAATTTTTATTGAATAGCTTATTAAGTTTTGGTATCATTTTTCTTAGCCCTAAGACACACAGACTTATCCACAGCATGTGCATAAGTCTGTGTGTAAATTGTTATTATAAAAATTTTATTATCCTGAGGGGGACCGGCCAdnaA
rpmHTTAAGACAGCATCCCCCTTACCACTTGTTAGATTACCAAAAATATGGAAAATTATAGGCGTATGTTCTCATTATATAGTATGCCCTTATTTTGAGTCAAGCAATGGTTTTGCAGTATTACTTATTATAGTATATACTGGAATTACACAGCATGTTAATAACTAGCTGTGGGAACTGTGGAAATTGTTTAAAAAATTACATATATTTCAATTTATTGGATACTTATCCAGGGTACAATTTTTATTGAATAGCTTATTAAGTTTTGGTATCATTTTTCTTAGCCCTAAGACACACAGACTTATCCACAGCATGTGCATAAGTCTGTGTGTAAATTGTTATTATAAAAATTTTATTATCCTGAGGGGGACCGGCCAdnaA
rpmhTTAAGACAGCATCCCCCTTACCACTTGTTAGATTACCAAAAATATGGAAAATTATAGGCGTATGTTCTCATTATATAGTATGCCCTTATTTTGAGTCAAGCAATGGTTTTGCAGTATTACTTATTATAGTATATACTGGAATTACACAGCATGTTAATAACTAGCTGTGGGAACTGTGGAAATTGTTTAAAAAATTACATATATTTCAATTTATTGGATACTTATCCAGGGTACAATTTTTATTGAATAGCTTATTAAGTTTTGGTATCATTTTTCTTAGCCCTAAGACACACAGACTTATCCACAGCATGTGCATAAGTCTGTGTGTAAATTGTTATTATAAAAATTTTATTATCCTGAGGGGGACCGGCCAdnaa
rpmHTTAAGACAGCATCCCCCTTACCACTTGTTAGATTACCAAAAATATGGAAAATTATAGGCGTATGTTCTCATTATATAGTATGCCCTTATTTTGAGTCAAGCAATGGTTTTGCAGTATTACTTATTATAGTATATACTGGAATTACACAGCATGTTAATAACTAGCTGTGGGAACTGTGGAAATTGTTTAAAAAATTACATATATTTCAATTTATTGGATACTTATCCAGGGTACAATTTTTATTGAATAGCTTATTAAGTTTTGGTATCATTTTTCTTAGCCCTAAGACACACAGACTTATCCACAGCATGTGCATAAGTCTGTGTGTAAATTGTTATTATAAAAATTTTATTATCCTGAGGGGGACCGGCCAdnaA
rpmHTTAAGACAGCATCCCCCTTACCACTTGTTAGATTACCAAAAATATGGAAAATTATAGGCGTATGTTCTCATTATATAGTATGCCCTTATTTTGAGTCAAGCAATGGTTTTGCAGTATTACTTATTATAGTATATACTGGAATTACACAGCATGTTAATAACTAGCTGTGGGAACTGTGGAAATTGTTTAAAAAATTACATATATTTCAATTTATTGGATACTTATCCAGGGTACAATTTTTATTGAATAGCTTATTAAGTTTTGGTATCATTTTTCTTAGCCCTAAGACACACAGACTTATCCACAGCATGTGCATAAGTCTGTGTGTAAATTGTTATTATAAAAATTTTATTATCCTGAGGGGGACCGGCCAdnaA
rpmHTTAAGACAGCATCCCCCTTACCACTTGTTAGATTACCAAAAATATGGAAAATTATAGGCGTATGTTCTCATTATATAGTATGCCCTTATTTTGAGTCAAGCAATGGTTTTGCAGTATTACTTATTATAGTATATACTGGAATTACACAGCATGTTAATAACTAGCTGTGGGAACTGTGGAAATTGTTTAAAAAATTACATATATTTCAATTTATTGGATACTTATCCAGGGTACAATTTTTATTGAATAGCTTATTAAGTTTTGGTATCATTTTTCTTAGCCCTAAGACACACAGACTTATCCACAGCATGTGCATAAGTCTGTGTGTAAATTGTTATTATAAAAATTTTATTATCCTGAGGGGGACCGGCCAdnaA
5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif SACAGCATSTBMATWASTABBTGTK

StartP-valueSite
3032.70e-13CAGACTTATCCACAGCATGTGCATAAGTCTGTGTGTAAATTGTTA
1455.65e-13ACTGGAATTACACAGCATGTTAATAACTAGCTGTGGGAACTGTGG
53.98e-12TTAAGACAGCATCCCCCTTACCACTTGTTAGATTACCAA

Motif CCTRAGRSRSACMGRC

StartP-valueSite
3567.02e-12ATTTTATTATCCTGAGGGGGACCGGCCA
2821.36e-09TTTTCTTAGCCCTAAGACACACAGACTTATCCACAG

Motif GGRTAC

StartP-valueSite
2298.23e-05TACTTATCCAGGGTACAATTTTTATT
2162.38e-04TCAATTTATTGGATACTTATCCAGGG
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score