RefSeq NC_002123
DoriC accession number pORI00000082
OriC length 1341 nt
OriC AT content 0.61
The location of oriC region 1116..161 nt
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OriC map
OriC sequences
GTGGCTATTATGTTAATGAGTTTGGATAAATTTTTTGTACAAGAAATGCAAAAAAATGGCTTTGATGTTGACTTTAAGCAATTGCAGAAAATATATACTTCGTCGAGAAAAAATAATGCTGAAGAAATTGCTAAACGTAAACGGATAGCTGAAAGGGAAAGAAATTTTATGCATGAAGCAATGGAGCAATATGATGTTGATCAATAAGCTTTTTTTGCTATAAAAAAAGCGCCATGGATTTTATTCCACAGCGCTTTTTTAGTAACTATTGCCTTAGCTCTGGCAAGCTAGCGAATTCGTATTAGTCAGTAGTCACCATCTTAAACAAATCAAGAATAGCATAATTCCGTTAAAGGGGCTAAAGGCGCACTTACACACCGAATGAAAATTCGGTGTGTTTTTACAGACTGTCTTAGATTTCGCTTTGCTCAAACAGAAAGAATACAAGGAATGCTATGAGCATAAAGGGACTGTGCATTTTTTCCAAAATTGACCCGTTTTGGAAAAAGATGAGCCGACAGTGTCGGCGTCCAAACCCTTGTTATAACTGCGATATTTAGTCCTAGGAAAATGCTACAATTACTTCTTGTAATATTTGTGCAGAATAGGGAGATGTGTAGCAAAATCCTAGGATACTTAAGCTAATTAAATGCTGTTAAACTGGGATTCTTGATTTTGGAAAAAACGATTAAAAAAGCATGCTAGGATTTTCCTAGCATGCTGGAACATGTTACAAAAATTAAGTTCAGTCGTTTACACTCCTTCGAACTTAATCCTTGTACCATGTTGCAATTAAAACCGAGTACTAGCTGGTAGTCAACGGTACCGGAACGACCAACGGGAGCGAGGATAAGGAGTTGACTAGCTAACTAAACCCAGACACTGAATTGGCTGAAAGCCAAAGTTTCCTAAACTTTGCTTTCCTGCCTTCACGACGAGTGATGGGGTGAGTTTGAGCGGGAGCACCCGCTCAAGTTTTGCGGTCAAGCTGGTTCAGCTTGGTCGGGGTTCGGGGCGACAGCGCCCGAGGGCTTGAAACTGGCGATTTTTGCCAGTTCCCTCTTATCTTGATACATACTAGACACAATTATTTTTTTCAAAACTGCCTTTAAGCCTTGACACGTCTGGCCTAAAGCGTATTATGATGGTATAAAACGAAACAATAAAAAAACCCACATGAGAATTCCTAGTTTGGCGACGGGGAACACGTGAGTTAATCTTGAATATTCGGATTTACTAGACATAGTTTAAAGCTTGAGTTAGTAAGCGTCAAGTCCTTAGTTCTAGTAAATACATAAAAGATTAACTCTTCTCACGTGGCTTGTGAGAGGAGCTTTTGAT
GTGGCTATTATGTTAATGAGTTTGGATAAATTTTTTGTACAAGAAATGCAAAAAAATGGCTTTGATGTTGACTTTAAGCAATTGCAGAAAATATATACTTCGTCGAGAAAAAATAATGCTGAAGAAATTGCTAAACGTAAACGGATAGCTGAAAGGGAAAGAAATTTTATGCATGAAGCAATGGAGCAATATGATGTTGATCAATAAGCTTTTTTTGCTATAAAAAAAGCGCCATGGATTTTATTCCACAGCGCTTTTTTAGTAACTATTGCCTTAGCTCTGGCAAGCTAGCGAATTCGTATTAGTCAGTAGTCACCATCTTAAACAAATCAAGAATAGCATAATTCCGTTAAAGGGGCTAAAGGCGCACTTACACACCGAATGAAAATTCGGTGTGTTTTTACAGACTGTCTTAGATTTCGCTTTGCTCAAACAGAAAGAATACAAGGAATGCTATGAGCATAAAGGGACTGTGCATTTTTTCCAAAATTGACCCGTTTTGGAAAAAGATGAGCCGACAGTGTCGGCGTCCAAACCCTTGTTATAACTGCGATATTTAGTCCTAGGAAAATGCTACAATTACTTCTTGTAATATTTGTGCAGAATAGGGAGATGTGTAGCAAAATCCTAGGATACTTAAGCTAATTAAATGCTGTTAAACTGGGATTCTTGATTTTGGAAAAAACGATTAAAAAAGCATGCTAGGATTTTCCTAGCATGCTGGAACATGTTACAAAAATTAAGTTCAGTCGTTTACACTCCTTCGAACTTAATCCTTGTACCATGTTGCAATTAAAACCGAGTACTAGCTGGTAGTCAACGGTACCGGAACGACCAACGGGAGCGAGGATAAGGAGTTGACTAGCTAACTAAACCCAGACACTGAATTGGCTGAAAGCCAAAGTTTCCTAAACTTTGCTTTCCTGCCTTCACGACGAGTGATGGGGTGAGTTTGAGCGGGAGCACCCGCTCAAGTTTTGCGGTCAAGCTGGTTCAGCTTGGTCGGGGTTCGGGGCGACAGCGCCCGAGGGCTTGAAACTGGCGATTTTTGCCAGTTCCCTCTTATCTTGATACATACTAGACACAATTATTTTTTTCAAAACTGCCTTTAAGCCTTGACACGTCTGGCCTAAAGCGTATTATGATGGTATAAAACGAAACAATAAAAAAACCCACATGAGAATTCCTAGTTTGGCGACGGGGAACACGTGAGTTAATCTTGAATATTCGGATTTACTAGACATAGTTTAAAGCTTGAGTTAGTAAGCGTCAAGTCCTTAGTTCTAGTAAATACATAAAAGATTAACTCTTCTCACGTGGCTTGTGAGAGGAGCTTTTGAT
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif GBSGDSRKTBKSRGCGDSMRMRCCCK

StartP-valueSite
10021.68e-13GTTCAGCTTGGTCGGGGTTCGGGGCGACAGCGCCCGAGGGCTTGAA
9446.80e-13GACGAGTGATGGGGTGAGTTTGAGCGGGAGCACCCGCTCAAGTTTT
5142.95e-12AAAAAGATGAGCCGACAGTGTCGGCGTCCAAACCCTTGTTATAACT

Motif MCTTAGTYCTDGTAA

StartP-valueSite
12766.32e-09AGCGTCAAGTCCTTAGTTCTAGTAAATACATAAAA
2721.64e-07GTAACTATTGCCTTAGCTCTGGCAAGCTAGCGAAT
7682.95e-07ACTCCTTCGAACTTAATCCTTGTACCATGTTGCAA
5553.94e-07TAACTGCGATATTTAGTCCTAGGAAAATGCTACAA
5784.96e-07AAAATGCTACAATTACTTCTTGTAATATTTGTGCA

Motif TDGCTGAAAGNSAAAG

StartP-valueSite
8891.30e-09GACACTGAATTGGCTGAAAGCCAAAGTTTCCTAAAC
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4251.28e-07AGATTTCGCTTTGCTCAAACAGAAAGAATACAAGGA
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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pORI00000265 78.205 156 20 12 851 1001 441 587 4.63e-18 88